Csapatai (játékosként): 1979–1984 Borussia M'Gladbach, 1984–1988 FC Bayern München, 1988–1992 Internazionale, 1992–2000 FC Bayern München, 2000 MetroStars

Csapatai (edzőként): 2001–2002 SK Rapid Wien, 2002–2003 Partizan Beograd, 2003–2005 Magyarország, 2006 Atlético Paranaense, 2006–2007 FC Red Bull Salzburg, 2008–2009 Maccabi Netanya, 2010–2011 Bulgária

1980 és 2000 között középpályásként 150 alkalommal volt válogatott, 23 gólt lőtt.

Edzőként dolgozott a Rapid Wien (2001. szeptember 6. – 2002. május 10.), majd a Partizan Beograd (2002. december 22. – 2003. december 13.). csapatánál. A Beograd után a magyar válogatottat vette át (2004. január 1.), majd mivel szerződését nem hosszabította meg a magyar szövetség, 2005. december 31-én lejárt. 2006-ban két hónapig a brazil Clube Atlético Paranaense-nál edzősködött. 2006. június 1-jén visszatért az osztrák bajnokságba, ahol a Red Bull Salzburg edzője lett. Itt Giovanni Trapattoni kezei alatt dolgozhat, Matthäus korábbi mestere ugyanis a Red Bull szakmai igazgatója.
Edzői munkája megosztja futballrajongókat és szakértőket. Sok kritika érte amiatt is, hogy a magyar válogatott szövetségi kapitányaként csak mintegy 60 napot töltött 2005-ben munkával. Az eredmények is elmaradtak, ígéretével szemben a csapat nem jutott ki a 2006-os németországi vb-re, de még így is jobban szerepelt a csapat mint a korábbi selejtezősorozatban. Sikeresen működött közre néhány nagy csapat elleni barátságos meccs megszervezésében, illetve ezeken a válogatott elért kiugró eredményeket is. Sok magyar játékosnak segített külföldre szerződni. Ezzel kapcsolatban viszont sokan kritizálták, hogy elsősorban a vele szoros gazdasági kapcsolatban álló managerek játékosait juttatta a válogatottban lehetőséghez, játéktudásuktól függetlenül. Erre utal, hogy soha nem látott számú fiatal kapott játéklehetőséget a válogatott meccseken, azonban az általa felfedezett több játékos a későbbiekben alapemberré vált a következő válogatottakban, illetve ért el sikereket külföldön. Matthäus nagyívű nyilatkozataival és elszólásaival, alkalmankénti cikkjeivel kedvelt témája volt a magyar és a brazil sajtónak is. A szurkolók többségében szerették, illetve a magasabb elvárások miatt sokkal több kritika is érte, azonban az őt szakmailag kritizálók által szorgalmazott váltás nem igazolódott be, hiszen a következő EB selejtező sorozatban katasztrofális vereségek érték a válogatottat, Matthäus teljesítményét jócskán alulmúlva.
2009 nyarán nem fogadta el az FC Fehérvár 2+1 éves szerződésajánlatát. 2010-ben megbízták a bolgár labdarúgó-válogatott irányításával, ám a nemzeti csapat sikertelensége miatt 2011 szeptemberében közös megegyezéssel szerződést bontottak.

Sikerei: Hétszer volt német Bundesliga bajnok (1985, 1986, 1987, 1994, 1997, 1999, 2000). Kétszer volt UEFA kupa-győztes (1991, 1996).1980-ban Európa-bajnok volt. 1990-ben világbajnok volt. 1990-ben és 1999-ben az év német labdarúgója, 1991-ben pedig az év labdarúgója volt.